什么！你的图上有一双看不见的手
下面这张吐槽LaTeX的图，太深得我心。
而ggplot2这种文本跑出界的事情，也太常见，以至于我在ggtree的FAQ专门指出来，要用xlim给x轴分配多点空间，这是由于数据是数据空间，而文本是像素空间。你画图的画布由数据空间决定，然后文本就从指定的位置（除了坐标，还取决于你align的方式和adjustment微调）开始打出来，一不小心就打出界了。这一点我在FAQ里，除了告诉你用xlim解决之外，我也给出了上面的解释，所以我一直强调，不要以为我在教ggtree，我其实是在教ggplot2。
后面就有人问了ggplot2字体溢出的事情，他所遇到的溢出，似乎更不应该发生，因为是坐标轴上的字体溢出，然而产生的原因是一样的，解决方案也是一样的，请用力猛戳《ggplot2字体溢出的那点破事》。
事情还可以更复杂些，我们知道ggtree有个facet_plot的函数，可以让你把不同的图层和进化树关联起来，这时候就有用户提出来，画进化树的那个分面tip label的字体溢出了，怎么能够单独给Tree panel设置xlim，于是我就写了xlim_tree这个函数来解决，《xlim_tree: set x axis limits for only Tree panel》。你们又以为我在教ggtree了，其实我又在教ggplot2，这个问题当然因为xlim_tree函数名就已经说明了是用于ggtree的，所以没看出门道来也正常。但我随后就又写了一篇，《facet_plot: 加图层到特定的分面上》，并且给出了xlim_expand函数，可以让你自由地设置任意分面的xlim，大家肯定还是没看出来，这和ggplot2有什么关系。我明说都不一定有人看，更何况没明说，还需要拐弯想一下的，肯定没人会想到。
不要以为ggtree的facet_plot画的是不同的图层，而你用ggplot2分面画的是同一数据的不同子集，没有本质区别。如果你在分面的时候用的是scales="free_x"，就有可能会出现有些分面正常，有些分面则会有《ggplot2字体溢出的那点破事》这种情况。这时候xlim()已经不能用了，因为你的scales是free的，你想要的是单独为字体溢出的分面设置xlim，解决方案就是我给出的。
内行看门道，这个expand_xlim，我在《facet_plot: 加图层到特定的分面上》里已经说了，其实就是在特定的分面上加图层，这个图层把画布撑大，但这个图层你看不见。因为它不会出来visible的东西（比如点和线），用的是geom_blank，顾名思义，它啥都不画。
然后虽然我这里讲的是xlim，你应该知道怎么搞ylim了。
沿着这个思路，事情还可以更进一步，在《映射变量给axis上色》一文中，其实我们就是用theme(element_text(color=COLOR_VECTOR))这样来给axis上色。但上色容易，想要给这个上色加个legend却不容易。解决的突破口就在于「一双看不见的手」。我们可以通过某个变量去上色打印文本, geom_text(aes(color=VAR))，这样就可以出来个文本按某个变量上色的legend。然而这个geom_text的图层是我们不愿意有的，我们并不想打印这些字，但我们想要它的legend。应用「看不见的手」的思路，我们打印字，但让这些字看不见，设置alpha=0，得以解决。当然这样legend也会看不见，我们通过修改legend，华丽丽地就给你的图穿上了皇帝的新衣。